Был создан в Нальчике по итогам форума «Россия и Абхазия 2008-2013: пятилетний опыт и перспективы сотрудничества». Возглавляет организацию Инга Гучапшева кандидат филологических наук, доцент КБГАУ им. В. М. Кокова, заведующая отделением среднего профессионального образования. НКЦ «Абхазия» – пример реализации социального проекта, направленного на межгосударственное сотрудничество в сфере культуры. Поскольку этнических абхазов проживает мало, диаспору в основном составляют студенты вузов, поэтому большинство мероприятий НКЦ проходит в образовательном формате.
